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Resumo
- O PCA encontra direções ortogonais de máxima variância e projeta os dados nas componentes principais.
- As razões de variância explicada fornecem uma forma quantitativa de escolher o número de componentes.
- O escalonamento de características afeta fortemente o PCA, portanto a padronização é frequentemente obrigatória.
Intuição #
O PCA gira o sistema de coordenadas em direção às direções que capturam a maior variação. Manter apenas os eixos mais fortes comprime os dados enquanto retém a estrutura dominante.
Explicação Detalhada #
1. Por que PCA? #
- Dados de alta dimensão são difíceis de interpretar e visualizar; o PCA encontra direções ortogonais que resumem a maior parte da variância.
- O método é não supervisionado: não usa rótulos, apenas a estrutura de covariância dos dados.
- Uma vez projetados nas componentes principais, podemos visualizar, remover ruído ou alimentar as características comprimidas a modelos subsequentes.
2. Matemática #
Dada a matriz de dados centrada em zero (X \in \mathbb{R}^{n \times d}):
- Matriz de covariância $$ \Sigma = \frac{1}{n} X^\top X $$
- Decomposição em autovalores $$ \Sigma v_j = \lambda_j v_j $$ onde (v_j) são autovetores (eixos principais) e (\lambda_j) autovalores (variância explicada).
- Projeção $$ Z = X V_k $$ usando os (k) autovetores principais.
3. Criar um conjunto de dados de exemplo #
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import japanize_matplotlib
from sklearn.datasets import make_blobs
X, y = make_blobs(n_samples=600, n_features=3, random_state=117117)
fig = plt.figure(figsize=(8, 8))
ax = fig.add_subplot(projection="3d")
ax.scatter(X[:, 0], X[:, 1], X[:, 2], c=y)
ax.set_xlabel("$x_1$")
ax.set_ylabel("$x_2$")
ax.set_zlabel("$x_3$")
4. Executar PCA com scikit-learn #
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
pca = PCA(n_components=2, whiten=True)
X_pca = pca.fit_transform(StandardScaler().fit_transform(X))
plt.figure(figsize=(8, 8))
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y)
plt.xlabel("PC1")
plt.ylabel("PC2")
plt.title("2-D embedding via PCA")
plt.show()
5. O escalonamento importa #
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
X, y = make_blobs(
n_samples=200,
n_features=3,
random_state=11711,
centers=3,
cluster_std=2.0,
)
X[:, 1] *= 1000
X[:, 2] *= 0.01
X_ss = StandardScaler().fit_transform(X)
pca = PCA(n_components=2).fit(X)
X_pca = pca.transform(X)
pca_ss = PCA(n_components=2).fit(X_ss)
X_pca_ss = pca_ss.transform(X_ss)
plt.figure(figsize=(10, 5))
plt.subplot(121)
plt.title("Unscaled features")
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y, marker="x", alpha=0.6)
plt.subplot(122)
plt.title("Scaled features")
plt.scatter(X_pca_ss[:, 0], X_pca_ss[:, 1], c=y, marker="x", alpha=0.6)
plt.show()
O PCA é dominado por características com grande variância; o escalonamento (ou branqueamento) é essencial quando as unidades das características diferem.
6. Considerações práticas #
- Razão de variância explicada: (\lambda_j / \sum_i \lambda_i) ajuda a decidir quantas componentes principais manter (geralmente 80-90%).
- Computação: o PCA é implementado via SVD internamente; use
svd_solver='randomized'para grandes conjuntos de dados. - Kernel PCA: quando o PCA linear não é suficiente, mude para kernels (veja a seção dedicada) ou tente UMAP/t-SNE para estrutura local.